Molekylærbiologi-laboratoriet ved SINTEF kombinerer moderne instrumenter med bred faglig kompetanse innen karakterisering og manipulering av genetisk materiale. Aktivitetene omfatter også bioprospektering der vi identifiserer, kartlegger og karakteriserer mikrobiom, nye biologiske ressurser, enzymer og bioaktive molekyler fra ulike naturlige miljøer.
Den omfattende plattformen av utstyr og digitale verktøy gir stor fleksibilitet, og gjør det mulig å koble avansert sekvenseringsteknologi med bioinformatiske analyser. Fasilitetene oppdateres jevnlig med nytt utstyr og teknologi for å sikre høy kvalitet og forskningsstandard. Laboratoriet er godkjent for arbeid med GMO og NGR (Nye Genetiske Ressurser).
Molekylærbiologiske instrumenter
- Short-read sekvensering: Illumina MiSeq
- Long-read sekvensering: ONT PromethION og MinION
- PCR-plattform (PCR, qPCR, RT‑PCR og ddPCR)
- Kapillær- og gelelektroforese: QIAxcel Connect, Puls‑Field Gel Electrophoresis (PFGE), ChemiDoc, DNA/RNA- og proteingel
- Kvantifiserings- og kvalitetsanalyse med Qubit 4 fluorometer og DeNovix DS-11 FX+ spektrofotometer/fluorometer
- Elektroporatorer for transformasjon
Utstyr for proteinproduksjon og analyse
- Sonikator, TissueLyser og annet homogeniseringsutstyr
- Blotting‑utstyr (Western, Southern)
Molekylærbiologiske metoder
- DNA- og RNA-ekstraksjon fra celler og miljøprøver
- Kloning og manipulering av DNA
- In vitro transkripsjon av RNA og kvalitetskontroll
- Translasjonsassays og enzymaktivitetsmålinger
- Studier av transkripsjon i prokaryoter og eukaryoter
Digitale og bioinformatiske verktøy
- Analyseprosesser for funksjonell genomikk
- Taksonomiske mikrobiomanalyser (OTU og ASV)
- Metagenomanalyse (short‑ og long‑read data)
- Bioprospektering for nye enzymer og bioaktive molekyler
- Prediksjon av proteinstruktur, samt modellering av protein–ligand-interaksjoner
Relevante prosjekter og laboratorier
PlastiSpread, AMBIOS, MARBLES, Bluetools, DisinfectAMR, DOPPLER LC, TASETRA, SFI-IB, BioBIVE, EnXylaScope.