Abstract
La necesidad de encontrar nuevos microrganismos de interés industrial ha llevado a buscarlos en ambientes diversos. Por ello, un nicho ecológico poco estudiado en relación con las bacterias, pero que puede albergar microorganismos de interés, es la madera en degradación. Esta degradación
es un proceso complejo en el que intervienen distintos agentes bióticos y abióticos, lo que la presenta como una fuente interesante de nuevas capacidades microbianas.
El género Bacillus es reconocido por su capacidad para la producción de diversos compuestos de aplicación biotecnológica. Ejemplo de esto son las moléculas con actividad biológica como policétidos, lipopéptidos o sideróforos. Así, una parte de estos compuestos como la surfactina, iturina o fengicina poseen actividad antifúngica.
Este trabajo se ha centrado en aislar y caracterizar microrganismos procedentes de madera en descomposición. Dentro de las 814 especies diferencialmente identificadas, 357 fueron bacterias de las cuales un 25% pertenecen al género Bacillus. Por medio de ensayos de competencia directa
se testó su capacidad de inhibir el crecimiento de hongos responsables de los principales tipos de podredumbre de la madera (blanca, marrón suave,…), seleccionándose de esta manera cepas que generaban una inhibición casi total.
Seguidamente se optimizó la producción de biomasa optimizando las condiciones de cultivo (temperatura, agitación y las concentraciones de fuente de carbono y nitrógeno) a través de un análisis de superficie de respuesta. Ello ha facilitado definir las condiciones que más afectan al crecimiento de las cepas analizadas, como son la temperatura y la concentración de la fuente de nitrógeno.
También se evaluó la producción de compuestos con capacidad antibiótica mediante el análisis de los productos secretados al medio en diferentes medios de cultivo. Así, el mayor efecto inhibitorio se observó en medio TB llegando a una inhibición radial del crecimiento de Aspergillus brasiliensis (hongo degradador de madera utilizado como indicador) de más de 30%.
Con todo ello, se seleccionó la cepa V17C11 por su capacidad para inhibir el crecimiento de hongos degradadores de madera al producir compuestos con actividad biocida. Por ello, esta cepa ha sido utilizada para secuenciar su genoma con una cobertura de 631x como fuente de agrupaciones génicas de interés. Éste presenta un tamaño de 3,6 Mb y más de 3700 marcos de lectura abierta. Lo que ha dado pie a otro análisis ómicos (p. ej. proteómica).
Este trabajo se encuadra dentro del proyecto europeo ProWood [Wood and derivatives protection by novel bio-coating solutions (http://www.era-ib.net/prowood, @ProWood_ERA_IB)] del programa ERA IB (7th Joint Call) y ha sido financiado por el Ministerio de Economía y Competitividad a través
de la convocatoria APCIN (Project ID: PCIN-2016-081).
es un proceso complejo en el que intervienen distintos agentes bióticos y abióticos, lo que la presenta como una fuente interesante de nuevas capacidades microbianas.
El género Bacillus es reconocido por su capacidad para la producción de diversos compuestos de aplicación biotecnológica. Ejemplo de esto son las moléculas con actividad biológica como policétidos, lipopéptidos o sideróforos. Así, una parte de estos compuestos como la surfactina, iturina o fengicina poseen actividad antifúngica.
Este trabajo se ha centrado en aislar y caracterizar microrganismos procedentes de madera en descomposición. Dentro de las 814 especies diferencialmente identificadas, 357 fueron bacterias de las cuales un 25% pertenecen al género Bacillus. Por medio de ensayos de competencia directa
se testó su capacidad de inhibir el crecimiento de hongos responsables de los principales tipos de podredumbre de la madera (blanca, marrón suave,…), seleccionándose de esta manera cepas que generaban una inhibición casi total.
Seguidamente se optimizó la producción de biomasa optimizando las condiciones de cultivo (temperatura, agitación y las concentraciones de fuente de carbono y nitrógeno) a través de un análisis de superficie de respuesta. Ello ha facilitado definir las condiciones que más afectan al crecimiento de las cepas analizadas, como son la temperatura y la concentración de la fuente de nitrógeno.
También se evaluó la producción de compuestos con capacidad antibiótica mediante el análisis de los productos secretados al medio en diferentes medios de cultivo. Así, el mayor efecto inhibitorio se observó en medio TB llegando a una inhibición radial del crecimiento de Aspergillus brasiliensis (hongo degradador de madera utilizado como indicador) de más de 30%.
Con todo ello, se seleccionó la cepa V17C11 por su capacidad para inhibir el crecimiento de hongos degradadores de madera al producir compuestos con actividad biocida. Por ello, esta cepa ha sido utilizada para secuenciar su genoma con una cobertura de 631x como fuente de agrupaciones génicas de interés. Éste presenta un tamaño de 3,6 Mb y más de 3700 marcos de lectura abierta. Lo que ha dado pie a otro análisis ómicos (p. ej. proteómica).
Este trabajo se encuadra dentro del proyecto europeo ProWood [Wood and derivatives protection by novel bio-coating solutions (http://www.era-ib.net/prowood, @ProWood_ERA_IB)] del programa ERA IB (7th Joint Call) y ha sido financiado por el Ministerio de Economía y Competitividad a través
de la convocatoria APCIN (Project ID: PCIN-2016-081).